Seit der Gründung des Systemhauses ASS-Software Odw. (heute ASS it-Systemhaus GmbH – www.ass-systemhaus.de) im Jahre 1989 ist er als Unternehmer selbstständig. Dem Geschäftssitz Brensbach folgte Roßdorf bei Darmstadt und schließlich der Umzug im Jahre 1998 nach Groß-Bieberau. In der Zwischenzeit gründete er die noch heute als Internet Service Provider aktive asis.net. Während der ersten Hochphase der New Economy 1999 bis 2001 war Schaffner Mitgründer und CTO von pizzamafia.de und der VivaSystems AG, den Vorläufern und technischen Wegbereitern der heutigen Online-Lieferdienste.
Nach dem Gewinn des StartUp Wettbewerbs von McKinsey, Stern, ZDF und den Sparkassen in der Sektion BusinessPlan gründete er gemeinsam mit Markus Müller (Profil) die new|frontiers Software GmbH (www.new-frontiers.de), der er noch heute als CEO vorsteht.